Unter WHO-Adminpanel gibt es kein spezielles Verzeichnis/Speicherort.
Wenn Sie möchten, können Sie sich aber gerne einen Ordner cgi-bin anlegen und die Scripte darin ablegen.
Der Ordner cgi-bin sowie die Scripte sollten die Zugriffsrechte 755 haben.
Ansonsten kann es zu Fehlfunktionen bzw. Fehlermeldungen im Browser (Error 500) kommen.